Projektberatung

Projektberatung

Bei so komplexen Fragestellungen wie der Proteincharakterisierung oder Analysen kompletter Proteome ist ein zuverlässiges Projektmanagement von der Projektidee bis zur Interpretation und Veröffentlichung bzw. Verwertung der Ergebnisse essentiell. Wir unterstützen Sie nicht nur in der reinen Durchführung Ihrer Versuche, wir ergänzen dies mit einer umfänglichen Projektbetreuung von Anfang bis Ende.

Strategieplanung und experimenteller Aufbau

Die strategische Planung und der experimentelle Aufbau der Versuche sind entscheidend für eine optimale Ergebnis-Ausbeute Ihrer Fragestellung betreffend. Dies umfasst folgende Schritte:

  • • die genaue Definition des Versuchsziels bzw. der Versuchsziele
  • • die Erarbeitung der optimalen und passenden Versuchsstrategie und der

    notwendigen Methoden gemeinsam mit Ihnen

  • • ein Vorschlag zu notwendigen Stichprobenmengen und Versuchsreplikaten,

    um statistisch relevante Ergebnisse zu erhalten

  • • bei umfangreichen Versuchen: eine Meilensteinplanung sowie die Definition

    von Abbruchkriterien

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Probenvorbereitung

Proteine können sich auf Grund der Vielzahl der möglichen Aminosäure-Zusammensetzungen stark in ihren Eigenschaften unterscheiden. So gibt es u.a. große und kleine, saure oder basische, hydrophile oder hydrophobe Proteine. Die Zugänglichkeit der jeweiligen Proteine für die Analyse ist somit abhängig vom verwendeten Extraktionsverfahren und Probenpuffer. Je nach Fragestellung und geplanten Methoden empfehlen wir eine geeignete Extraktionsmethode oder übernehmen für Sie Extraktion und Probenvorbereitung.

Projektdurchführung

Die Durchführung der geplanten Experimente können wir komplett oder teilweise für Sie übernehmen. Sie können jedoch auch alle praktischen Arbeiten selbst übernehmen. Bei Komplikationen stehen wir Ihnen selbstverständlich mit unserem theoretischen und praktischen Know-How beratend zur Seite oder bieten Hands-on Workshops bei Ihnen vor Ort an.

Evaluierung von Ergebnissen

Schon einfache Protein-Identifzierungen per Massenspektrometrie liefern eine Vielzahl an Daten, die es zu interpretieren gilt. Der Umfang der ermittelten Daten nimmt entsprechend mit zunehmendem Versuchsumfang und Fragestellung zu. Wir stellen Ihnen nicht einfach die erhaltenen Daten zur Verfügung, wir geben Hilfestellung bei der Interpretation der Daten, Empfehlungen für eventuelle Folgeversuche oder weitere statistische Auswertungen sowie Hinweise zur Publikation oder patentrechtlichen Verwertung der Ergebnisse.

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Weitere Informationen/ Preisanfragen

Für Fragen, Informationen und Preisangebote setzen Sie sich bitte mit unseren Service-Team in Verbindung, wir beraten Sie gerne:

Mo - Fr 9 -17h
+ 49 (0) 345 2799 6413

servicedyeagnostics.com

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Unser Leistungsspektrum

  • • Proteomstudien (Shot Gun)
  • • Proteomstudien 2DE-basiert
  • • Label u. labelfreie Proteinquantifizierung
  • • Proteincharakterisierung (Quantifizierung, Reinheit, Modifikation, Identifikation)
  • • Mutagenisis Discovery
  • • Mircoarray Follow-up
  • • Drug Target Discovery
  • • Assay Development
  • • Protein Pattern Analysis
  • • toxikologische Fingerprint-Analysen
  • • Saatguttestung
  • • Proteinverunreinigungen
  • • Beratung für komplexe Proteinanalysen
  • • Differentielle Proteingelektrophorese (2D-DIGE)
  • • Post-translationale Proteinmodifikationen (Phosphorylierungen, Glykosylierungen, Oxidation/ Reduktion)
  • • Identifikationen von Isoformen und Splicing-Varianten
  • • Biomarker-Discovery
  • • 2D Western Blotting
  • • HCP Coverage 2D Western Blotting
  • • Standardisierte and quantitative SDS- und SAR-PAGE, IEF sowie Western Blots mit bis zu 52 Proben pro Lauf

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Ausstattung für die Gel-basierte Protein Analytik

  • • OCRA Gel Electrophoresis Units
  • • Dolphin Gel Electrophoresis Units
  • • HOEFER SE900 Gel Electrophoresis
  • • HOEFER Gel Electrophoresis small
  • • BEO Dry Blotter
  • • VELUM Dry Blotter
  • • OCTOPLUS QPLEX Fluorescence Imager
  • • Typhoon FLA 9000 Imager
  • • HOEFER IEF 100
  • • LabImage L360 Software
  • • Delta2D Software
  • • Spot Picker
  • • Spot Processing
  • • Fluorescent Label
  • • VIS- und Fluoreszenz-Stains

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Ausstattung & Methodik für die Massenspektrometrie

  • • Synapt High Definition MS-Systeme (HD-MS, Waters)
  • • Q Exactive Plus Hybrid Quadrupole-Orbitrap MS (Thermo)
  • • Xevod TQD Tandem Quadrupol MS-System (Waters)
  • • MALDI-TOF/TOF (ultraflex, Bruker Daltonics)
  • • MS/MS und HD-MSE
  • • ESI, nano-ESI, MALDI
  • • SRM, PRM und MRM
  • • UPLC, nano-UPLC
  • • diverse Bioinformatische Tools

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Selected References

Logo Universitätsklinikum Leipzig

Logo Forschungszentrum Borsten - Leibniz Lungenzentrum

Logo Universitätsklinikum Halle (Saale) UKH

Logo UKB Universitätsklinikum Bonn

Logo Universität Greifswald

Logo Hanns-Knöll-Institut HKI

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Logo Merck_Millipore who is Merck Millipore is a customer of NH DyeAGNOSTICS protein services.

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Logo Proteomic Solutions

Logo Roche AG, Roche GmbH

Logo TARRC Tun Abdul Razak Research Centre

Logo NIFES National Institute of Nutrition ans Seafood Research

Logo WADA Laboratory IDAS Dresden

Logo Beiersdorf AG

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